Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr5Q9Z1P4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms