Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sfrp4Q9Z1N6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms