Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms