Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rspo1Q9Z132 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rspo1Q9Z132 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rspo1Q9Z132 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rspo1Q9Z132 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rspo1Q9Z132 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rspo1Q9Z132 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rspo1Q9Z132 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rspo1Q9Z132 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms