Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms