Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms