Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clip2Q9Z0H8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clip2Q9Z0H8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms