Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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