Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn8aQ9WTU3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms