Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdh13Q9WTR5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms