Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx6Q9R1R0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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