Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trex2Q9R1A9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms