Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed2Q9R0Q3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms