Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod3Q9R0E1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms