Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BcamQ9R069 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BcamQ9R069 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms