Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms