Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms