Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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