Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a3Q9QZS0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms