Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afyQ9QZQ8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms