Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms