Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp21Q9QZL6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms