Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr4a3Q9QZB6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms