Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnt3Q9QZ47 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms