Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phtf1Q9QZ09 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms