Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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