Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copg2Q9QXK3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copg2Q9QXK3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms