Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms