Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim44Q9QXA7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms