Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyhr1Q9QXA1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms