Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rai2Q9QVY8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms