Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Msh5Q9QUM7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Msh5Q9QUM7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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