Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabgef1Q9JM13 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rabgef1Q9JM13 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rabgef1Q9JM13 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rabgef1Q9JM13 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rabgef1Q9JM13 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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