Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bace2Q9JL18 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bace2Q9JL18 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms