Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a3Q9JKZ2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc5a3Q9JKZ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms