Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Upk3aQ9JKX8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Upk3aQ9JKX8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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