Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp4Q9JKV5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms