Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Habp4Q9JKS5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms