Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ldb3Q9JKS4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms