Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pole3Q9JKP7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pole3Q9JKP7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pole3Q9JKP7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pole3Q9JKP7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pole3Q9JKP7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms