Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms