Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms