Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pard6bQ9JK83 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms