Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msgn1Q9JK54 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms