Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ube2j1Q9JJZ4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ube2j1Q9JJZ4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ube2j1Q9JJZ4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ube2j1Q9JJZ4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2j1Q9JJZ4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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