Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Alyref2Q9JJW6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Alyref2Q9JJW6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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