Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup50Q9JIH2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup50Q9JIH2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms