Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms