Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms