Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp4Q9JHB3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms